Répondre à Das

Au rédacteur-Dans la correspondance , Sushmita Das discute des méthodes de prise d’empreinte parasite utilisées dans notre rapport sur l’échec de la miltéfosine pour le traitement de la leishmaniose viscérale au Népal L’empreinte digitale est un support majeur pour l’interprétation des études sur l’efficacité thérapeutique des maladies infectieuses : la comparaison des agents pathogènes présents au début du traitement et lors d’un nouvel épisode clinique vise à distinguer les rechutes des réinfections, la première étant critique pour l’efficacité des médicamentsCe suivi moléculaire nécessite une méthode de génotypage hautement discriminatoire, pour augmenter le pouvoir de rejeter hypothèse d’identité nulle entre les échantillons La tâche est compliquée lorsque la population pathogène étudiée est génétiquement homogène: comment distinguer une rechute d’une réinfection d’un même génotype Par ailleurs, le degré d’homogénéité génétique dépend également de la méthode de génotypage utilisée Das souligne correctement la confusion possible qui peut découler de la littérature, avec quelques études rapportant l’homogénéité génétique chez Leishmania donovani du sous-continent indien ISC, tandis que d’autres mentionnent l’occurrence du polymorphisme génétique. Une définition claire du polymorphisme génétique est nécessaire, et surtout, elle doit être interprétée dans le contexte du génotypage méthode elle-même On ne peut prétendre que L donovani d’ISC est polymorphe à cause de l’apparition de zymodèmes dans la région ; ceci signifie seulement qu’avec l’électrophorèse enzymatique multilocus MLEE, une méthode à pouvoir résolutif limité, des variants génétiques ont été observés dans cette population. Le typage multilatellite microsatellite MLMT est plus résolutif et a montré qu’il détectait des variants génétiques dans un échantillon de parasites ISC, alors que dans le même échantillon de souches, typage multilonucléotidique MLST des génotypes mis en évidence Il n’y a pas de contradiction entre ces différents rapports, mais les polymorphismes génétiques doivent être décrits par comparaison avec d’autres populations de parasites Par exemple, chacune des méthodes moléculaires mentionnées ci-dessus détectent moins de polymorphismes génétiques chez les L donovani d’ISC que L donovani d’Afrique de l’Est L donovani d’ISC peut en effet être considéré comme une espèce polymorphe relativement faible: des découvertes récentes suggèrent que cela résulte d’une expansion clonale récente suite à une campagne de DDT antipaludique dans le s [, ] Au moment de la réalisation de notre étude clinique , la méthode la plus discriminatoire av L’analyse de kinétroplaste ADN polymérase en chaîne-polymorphisme de longueur de fragment de restriction, dont on a montré précédemment qu’elle permettait de résoudre deux fois plus de génotypes que MLMT, était nécessaire pour le MLEE, MLMT ou MLST de L donovani. Pendant le suivi moléculaire, des génotypes presque identiques ont été rencontrés chez chaque patient au début du traitement et au moment de la rechute, alors que des souches avec différents génotypes ont été observées entre les différents patients L’explication la plus parcimonieuse est que la même souche a survécu. traitement; Ainsi, une méthode de génotypage ultime telle que le séquençage du génome entier révélerait probablement de petites différences entre les paires d’échantillons et offrirait plus de puissance à l’analyse bloc auriculo-ventriculaire. Des développements supplémentaires sont encore nécessaires pour permettre leur application directe sur des échantillons cliniques.

Remarque

Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit signalé Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent comme pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués